Alle vore flagermus lever udelukkende af insekter og edderkopper.

Generelt lever de store flagermus at store insekter som oldenborre og store natsværmere, og de små flagermus af myg, guldøjer o.lign.

Byttet fanges både i luften og plukkes på overfladen af blade, grene, vandløb og søer. Strategien her afhænger meget at hvilken art der er tale om. På lofter og i kældre kan man af og til finde en del vinger af nældens takvinge og dagpåfugleøje, to sommerfugle, som overvintrer på disse steder sammen med flagermus, hvilket tydeligvis kan være risikabelt!

De fleste flagermus æder byttet umiddelbart efter fangsten, men langøret flagermus flyver ofte hen til en foretrukkent ædeplads.

Noget tyder på at flagermusene med deres ultralydsskrig til en vis grad kan artsbestemme byttedyret og bl.a. vælge de insekter fra der smager elendigt!

Det er store mængder insekter, der fanges. Dværgflagermus sætter ikke mindre end 2-3000 insekter til liv hver eneste nat!